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明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫，中醫式微。少年醫者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫發揚光大。李子明醫者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。

面癱的貧窮少女米娜吉沒有想過有這一天： 這個國家最有錢的富翁竟然會找到她，并對外宣布：我找到了我的親孫女！ 驕傲的少年胡格也沒有想過這一天： 身為最大財閥唯一繼承人、蟬聯理想型男友第一名的自己，居然只不過是只占了別人巢穴的斑鳩？ 兩個冤家的相遇，是命運的黑手？還是上天另有安排