原本中醫系畢業的張機，因為中醫不容樂觀的就業情勢，于是打算轉行“更有前途”的西醫。然而某天他回家后，發現家中多了位不速之客——醫仙【岐伯】。岐伯以“因為你是張機（張仲景）”為理由，將“重振中醫”交給了張機。 為了讓張機可以勝任“重振中醫”的重任，岐伯遣藥靈親自教導張機中藥的配伍使用，并將一本可以與藥靈訂立契約的《玉函本草集》交由張機，同時讓人參【任弦】作為張機的幫助與監督者。

故事在廢土風格基礎上架構了一個極具頹廢氣息的末世界，具有魔族血統被視為異類的主角在爾虞我詐的世界里，希冀去實現自己近乎渺茫的理想——擁有一位真正的朋友。在主角的任務過程中，偶然結識到的一位伙伴正逐步打開著主角的心扉。

18歲那年，楚凡斬殺魔族統領，走出封門村，沒想到卻被白家退婚。得知此事的幾個師姐，紛紛希望將楚凡拐到自己家中。本以為能夠享受齊人之福，然而楚凡卻發現，魔族統領，異人，天府，虛空中的玄牝之門，以及周圍飄蕩的神靈尸體，乎都在訴說著一件事——這個世界并沒有那么簡單......