原本中醫系畢業的張機，因為中醫不容樂觀的就業情勢，于是打算轉行“更有前途”的西醫。然而某天他回家后，發現家中多了位不速之客——醫仙【岐伯】。岐伯以“因為你是張機（張仲景）”為理由，將“重振中醫”交給了張機。 為了讓張機可以勝任“重振中醫”的重任，岐伯遣藥靈親自教導張機中藥的配伍使用，并將一本可以與藥靈訂立契約的《玉函本草集》交由張機，同時讓人參【任弦】作為張機的幫助與監督者。

世人都說皇帝英俊瀟灑玉樹臨風知人善任 勤儉愛民勵精圖治………… 好到三天三夜都說不完 然而，全天下只有我一個人知道，皇帝，有病 而且病得不輕！

在未來科學家制造了“盤古”這臺毀壞力超強的戰爭機器。公元2139年世界大戰爆發，“盤古”被用于戰爭。 世界大戰結束后，盤古被銷毀。 然而戰爭結束16年后，盤古神秘復活，并有自己的思想，覺得自己當年被遺棄，懷恨在心，決定復仇人類，自己制造出具有行動能力的機器，并開始大量制造各種戰爭機器人，開始報復人類，大舉進攻人類。

死后五百年，還被人們銘記的人，他們的靈魂便可以成為“靈體”。 根據現代人的印象，呈現出與生前的人形不同的形態。如今，不少歷史上的著名人物成為“靈體”，在新的時代，述寫新的傳奇。作品獨創性的提出“魂”與“靈體”之間關系的概念——一直被人們記住的歷史人物的“魂”最后幻化成了“靈體”寄宿在了后來的一代又一代的人身上，并永不停息的持續著“他們”之間的戰爭，此所謂“魂戰紀”。