故事講述了個性開朗喜歡搗亂的小學生布丁，和性格有點暴躁的黃連，倆人的日常校園生活故事。

混混少年秦明，文弱書生白齊，一個是設局人，一個是解局人；一個是陰差陽錯，一個是蓄謀已久。二人通過選拔，攜手進入金吾衛，雖屢遭到權貴刁難，二人憑借膽識及能力硬是殺出了一條血路。

撥開重重的殺人謎案，顯露出來的便是唯一的真相，當事實被一點點挖掘，推理出的竟然是人心。自古英雄男兒，紅顏多少神傷，女人的悲歌能否戛然而止，同時在陽光下肆意生長著的，還有那段純真的風云緣。 傳承毒術的女人們更是被人們所誤解，在風起云涌的皇室權力爭奪中，探案師與毒娥的終極對決展開了。

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫，中醫式微。少年醫者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫發揚光大。李子明醫者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。