原本中醫系畢業的張機，因為中醫不容樂觀的就業情勢，于是打算轉行“更有前途”的西醫。然而某天他回家后，發現家中多了位不速之客——醫仙【岐伯】。岐伯以“因為你是張機（張仲景）”為理由，將“重振中醫”交給了張機。 為了讓張機可以勝任“重振中醫”的重任，岐伯遣藥靈親自教導張機中藥的配伍使用，并將一本可以與藥靈訂立契約的《玉函本草集》交由張機，同時讓人參【任弦】作為張機的幫助與監督者。

白以茉一直崇拜自己青梅竹馬長大的男神高梓晨，并考入了高梓晨所在的學校。在學校里以茉認識了搞怪仗義的女孩左小拉，一心想要贏得高冷男神的小迷妹，在自己最佳損友的幫助下，開啟一段轟轟烈烈的大作戰！

毛依蘭，人稱“毛豆”，毛豆和董忱源系一脈，師出同門，無奈兩人自幼便是一對小冤家，逢則必斗。陰差陽錯間，毛豆成了董忱后廚一員，他手把手教她做菜，毛豆也漸漸陷入了他愛情的圈套，無奈董忱身邊鶯鶯燕燕絡繹不絕，因此兩人始終也不過是鐵哥們兒。在毛豆重蹈初戀的覆轍、擺脫相親對象的追求，并經歷了富二代的愛情之后，最終得到董忱的一顆真心。并且毛豆也在董忱的悉心教導和幫助下，逐漸成長為名副其實的“料理女王”。

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫，中醫式微。少年醫者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫發揚光大。李子明醫者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。