明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫，中醫式微。少年醫者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫發揚光大。李子明醫者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。

女主陽蘿目睹母親被吸入一本天書，為了尋回母親，陽蘿開始四處收集天書，并在“藏書閣”昴和男主人公習語的陪伴下，克服了種種困難。隨著收集的天書越多，陽蘿發現母親竟然是天書里面的人物，并與身為人類的父親產生了愛的結晶，生下了自己。陽蘿有一半天書血統的事瞬間引起了很多藏書閣的注意，并對陽蘿采取了回收行動。于是陽蘿一邊應對這些藏書閣，一邊加快速度收集天書。

一個滿是“門”的空間，這里被稱之為閥限世界，在這里門就是水閥，怪物是水流，一旦閥門失控怪物便會破門而出，如潮水般的涌入現實世界， 而兩個時間線里的兩支隊伍，分別是無以名為首的神仙組，段武常為首的超物質調查團隊，他們為阻止這場末日浩劫，決定奮力一戰！ 隨著調查的深入，一個更大的陰謀浮出水面！

第一次見面，她踐踏了他的尊嚴。 再次見面，他是高高在上的王，她是低到塵埃的花。 一份價值兩億的契約，將她困在他身旁……