一克帝國英雄傳2承接一克帝國英雄傳漫畫劇情，是第一部的正統續作，一克帝國一統十四州后，來自四方的威脅仍未解除，大正皇王思北一聲令下開啟了十四州外異域地區的東伐西討、南征北戰，以及探秘發現未知區域及其他國度的奇幻旅程（根據小說一克帝國異域志內容改編而成）。

原本中醫系畢業的張機，因為中醫不容樂觀的就業情勢，于是打算轉行“更有前途”的西醫。然而某天他回家后，發現家中多了位不速之客——醫仙【岐伯】。岐伯以“因為你是張機（張仲景）”為理由，將“重振中醫”交給了張機。 為了讓張機可以勝任“重振中醫”的重任，岐伯遣藥靈親自教導張機中藥的配伍使用，并將一本可以與藥靈訂立契約的《玉函本草集》交由張機，同時讓人參【任弦】作為張機的幫助與監督者。

主人公周元，為周朝皇子天生圣龍氣運。因一道預言，氣運被奪身中劇毒，經脈被鎖無法修煉。背負國仇家恨，周元沒有被這種困境摧毀，而是靠著堅強意志重開八脈，在家族存亡的危機時刻強勢崛起。未來路漫漫兮，天生大才注定不凡的少年將在修行路上繼續鏗鏘前行…

第一次見面，她踐踏了他的尊嚴。 再次見面，他是高高在上的王，她是低到塵埃的花。 一份價值兩億的契約，將她困在他身旁……