這家叫做“妙藥堂”的中醫診所，他的擁有者是家里世代行醫的唐本草。這個診所不光給人看病，還接待一些神秘奇異的妖怪……在大夫與病人之間，在人類與妖怪之間，發生了各種各樣的故事……

女主陽蘿目睹母親被吸入一本天書，為了尋回母親，陽蘿開始四處收集天書，并在“藏書閣”昴和男主人公習語的陪伴下，克服了種種困難。隨著收集的天書越多，陽蘿發現母親竟然是天書里面的人物，并與身為人類的父親產生了愛的結晶，生下了自己。陽蘿有一半天書血統的事瞬間引起了很多藏書閣的注意，并對陽蘿采取了回收行動。于是陽蘿一邊應對這些藏書閣，一邊加快速度收集天書。

很久以前，妖獸橫行，禍害人間，百姓民不聊生。就在這時，一位仙人出現，他將妖獸引領到一個世外秘境，這個秘境被后人稱之為“山海界”。 數百年過去了，某一天仙人設下的結界受到破壞，部分靈獸出逃人間，為了將靈獸尋回，現任守界者靈發仙人來到人類的世界。然而此時此刻，孟然和同學正因為誤闖后山而遇到傳說中的兇獸窮奇……