明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫，中醫式微。少年醫者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫發揚光大。李子明醫者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。

女主陽蘿目睹母親被吸入一本天書，為了尋回母親，陽蘿開始四處收集天書，并在“藏書閣”昴和男主人公習語的陪伴下，克服了種種困難。隨著收集的天書越多，陽蘿發現母親竟然是天書里面的人物，并與身為人類的父親產生了愛的結晶，生下了自己。陽蘿有一半天書血統的事瞬間引起了很多藏書閣的注意，并對陽蘿采取了回收行動。于是陽蘿一邊應對這些藏書閣，一邊加快速度收集天書。

天雨星是一個與眾不同的男生，頭腦聰明，體育全能，并且不管參加什么比賽，都能奪得冠軍。然而年復一年，他厭倦了這些，總想做些不一樣的事情。雖然他參加過不少興趣班，但是他都不感興趣，他甚至不知道自己喜歡干什么【其實有喜歡做的事，甚至把它定為最終目標，不過家人反對，就放棄了】。直到有一天他收到一張傳單，告訴他有一個叫“夢想世界”的地方，可以做任何自己喜歡的事情，男生滿懷欣喜的來到在這里，本以為終于可以開心做自己喜歡的事了，卻沒想到自己陷入到一個陰謀當中......