原本中醫系畢業的張機，因為中醫不容樂觀的就業情勢，于是打算轉行“更有前途”的西醫。然而某天他回家后，發現家中多了位不速之客——醫仙【岐伯】。岐伯以“因為你是張機（張仲景）”為理由，將“重振中醫”交給了張機。 為了讓張機可以勝任“重振中醫”的重任，岐伯遣藥靈親自教導張機中藥的配伍使用，并將一本可以與藥靈訂立契約的《玉函本草集》交由張機，同時讓人參【任弦】作為張機的幫助與監督者。

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫，中醫式微。少年醫者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫發揚光大。李子明醫者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。

武道，決定命運，決定生死，弱者，受人欺凌，強者，俯瞰天下。這是一個恃強凌弱的世界，人們以武道修為來定等級論高低。各大門派為了爭奪最強之名，一直明爭暗斗。在這里，只有強者有權利生存下去，即使是同族同門之人，若是實力弱小，也只有被驅趕欺凌的下場。

夜幕降臨，賣萌裝狠了一整天的動物們終于有了放松的時間，動物園的地下室（禽獸）酒館開始營業。這里有喜歡喝酒但注重養生的熊貓乖爺（中年發福），有喜歡嘻哈隨時隨地freestyle的老板兼DJ葵花鸚鵡，有（自認為）高冷的面癱藏狐小方……有趣的動物客人們紛紛登場，展現和白天的自己截然不同的一面