原本中醫系畢業的張機，因為中醫不容樂觀的就業情勢，于是打算轉行“更有前途”的西醫。然而某天他回家后，發現家中多了位不速之客——醫仙【岐伯】。岐伯以“因為你是張機（張仲景）”為理由，將“重振中醫”交給了張機。 為了讓張機可以勝任“重振中醫”的重任，岐伯遣藥靈親自教導張機中藥的配伍使用，并將一本可以與藥靈訂立契約的《玉函本草集》交由張機，同時讓人參【任弦】作為張機的幫助與監督者。

2333年，地球被寒，藻，葳，雛，炎，氣，六星攻占，長得好看的人成為寵物，長得丑的被丟到荒野沙漠自生自滅。六星人養膩了現代人想養古人，于是發明了名將機，啟動后能穿越時空抓古人。誰知，天真的葳星少女伊塔一發入魂，抓到了秦始皇嬴政，給六星帶來了毀滅性打擊。寄（外星）人籬下的秦始皇與同人文寫手徐君房和總想暗殺自己的張良以及其他被抓來的千古名將們放下前朝舊恨共同抵御天外之敵！

十萬年前，忘仙宗老祖陳玄無敵于天下卻在巔峰時退隱，無人知曉，他是因系統金手指故障無法繼續突破，擔心晚節不保，才隱居世間的。某天，宗門后代女弟子前來求救，卻讓系統成功重啟……只要培養后代，他可以繼續變強，可以繼續獨斷萬古！躲了十萬年的玄天帝，帶著全新的金手指出山了……