千年蛇妖趁封印變弱逃了出來后被老板所救，機緣巧合下遇見了前往陽界收回冥魂的判官大人崔鈺。

這家叫做“妙藥堂”的中醫診所，他的擁有者是家里世代行醫的唐本草。這個診所不光給人看病，還接待一些神秘奇異的妖怪……在大夫與病人之間，在人類與妖怪之間，發生了各種各樣的故事……

原本中醫系畢業的張機，因為中醫不容樂觀的就業情勢，于是打算轉行“更有前途”的西醫。然而某天他回家后，發現家中多了位不速之客——醫仙【岐伯】。岐伯以“因為你是張機（張仲景）”為理由，將“重振中醫”交給了張機。 為了讓張機可以勝任“重振中醫”的重任，岐伯遣藥靈親自教導張機中藥的配伍使用，并將一本可以與藥靈訂立契約的《玉函本草集》交由張機，同時讓人參【任弦】作為張機的幫助與監督者。

林向夢與青梅竹馬李俊馳同校就讀，應其合租邀請搬入校外公寓。本以為只是普通合租，卻意外揭開室友們的驚人秘密：李俊馳及室友們竟是靈裔后代。這段突如其來的奇幻揭秘，讓林向夢的世界觀徹底顛覆，也讓她在驚訝之余，收獲了超越種族的深厚友情與前所未有的生活體驗。