故事在廢土風格基礎上架構了一個極具頹廢氣息的末世界，具有魔族血統被視為異類的主角在爾虞我詐的世界里，希冀去實現自己近乎渺茫的理想——擁有一位真正的朋友。在主角的任務過程中，偶然結識到的一位伙伴正逐步打開著主角的心扉。

男主原是現代世界普通大學生，某天偶遇算命人并被告知災禍將至，若不破解恐性命之危。因此男主接過山海玄中錄且答應完成書中各妖娘所在世界對應的任務......回家后，男主翻開山海玄中錄第一頁出現攻略人物，瞬間被吸入書中，由此正式開啟第一個攻略任務。

一個荒廢的小鎮里出現了恐怖的生物……

這家叫做“妙藥堂”的中醫診所，他的擁有者是家里世代行醫的唐本草。這個診所不光給人看病，還接待一些神秘奇異的妖怪……在大夫與病人之間，在人類與妖怪之間，發生了各種各樣的故事……