死后五百年，還被人們銘記的人，他們的靈魂便可以成為“靈體”。 根據(jù)現(xiàn)代人的印象，呈現(xiàn)出與生前的人形不同的形態(tài)。如今，不少歷史上的著名人物成為“靈體”，在新的時代，述寫新的傳奇。作品獨(dú)創(chuàng)性的提出“魂”與“靈體”之間關(guān)系的概念——一直被人們記住的歷史人物的“魂”最后幻化成了“靈體”寄宿在了后來的一代又一代的人身上，并永不停息的持續(xù)著“他們”之間的戰(zhàn)爭，此所謂“魂戰(zhàn)紀(jì)”。

武道，決定命運(yùn)，決定生死，弱者，受人欺凌，強(qiáng)者，俯瞰天下。這是一個恃強(qiáng)凌弱的世界，人們以武道修為來定等級論高低。各大門派為了爭奪最強(qiáng)之名，一直明爭暗斗。在這里，只有強(qiáng)者有權(quán)利生存下去，即使是同族同門之人，若是實(shí)力弱小，也只有被驅(qū)趕欺凌的下場。

男主原是現(xiàn)代世界普通大學(xué)生，某天偶遇算命人并被告知災(zāi)禍將至，若不破解恐性命之危。因此男主接過山海玄中錄且答應(yīng)完成書中各妖娘所在世界對應(yīng)的任務(wù)......回家后，男主翻開山海玄中錄第一頁出現(xiàn)攻略人物，瞬間被吸入書中，由此正式開啟第一個攻略任務(wù)。

原本中醫(yī)系畢業(yè)的張機(jī)，因?yàn)橹嗅t(yī)不容樂觀的就業(yè)情勢，于是打算轉(zhuǎn)行“更有前途”的西醫(yī)。然而某天他回家后，發(fā)現(xiàn)家中多了位不速之客——醫(yī)仙【岐伯】。岐伯以“因?yàn)槟闶菑垯C(jī)（張仲景）”為理由，將“重振中醫(yī)”交給了張機(jī)。 為了讓張機(jī)可以勝任“重振中醫(yī)”的重任，岐伯遣藥靈親自教導(dǎo)張機(jī)中藥的配伍使用，并將一本可以與藥靈訂立契約的《玉函本草集》交由張機(jī)，同時讓人參【任弦】作為張機(jī)的幫助與監(jiān)督者。

一個滿是“門”的空間，這里被稱之為閥限世界，在這里門就是水閥，怪物是水流，一旦閥門失控怪物便會破門而出，如潮水般的涌入現(xiàn)實(shí)世界， 而兩個時間線里的兩支隊(duì)伍，分別是無以名為首的神仙組，段武常為首的超物質(zhì)調(diào)查團(tuán)隊(duì)，他們?yōu)樽柚惯@場末日浩劫，決定奮力一戰(zhàn)！ 隨著調(diào)查的深入，一個更大的陰謀浮出水面！