蘇進因為意外死亡穿越到了另一個時空，在這里他見證了另一個版本的華夏文明——X宮變成了古玩街，樂X大佛垮了一半，敦X壁畫被風沙侵蝕，莫X窟變成了無頭窟。文物破損，修復技術流失，他決定用自己的技術成為一名修復師，從事他最愛的文物修復工作，改變這個世界！

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明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫，中醫式微。少年醫者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫發揚光大。李子明醫者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。