唐小宇好好上著學，突然媽媽失蹤，被從天而降的暴脾氣鳥人唬著簽了契約，從此跟著鳥人打怪升級找隊友找媽媽，聽說還要拯救世界？ 面對一夜之間崩塌的世界觀，唐小宇憋不住吐槽，“不是說好建國后不能成精嗎？” 鳥人精衛冷漠：“白癡，我是宇宙聯盟的新人類。” 唐小宇：口胡！這新人類還挺帥！還一天到晚搶我的風頭！！

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫，中醫式微。少年醫者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫發揚光大。李子明醫者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。

這家叫做“妙藥堂”的中醫診所，他的擁有者是家里世代行醫的唐本草。這個診所不光給人看病，還接待一些神秘奇異的妖怪……在大夫與病人之間，在人類與妖怪之間，發生了各種各樣的故事……