18歲那年，楚凡斬殺魔族統領，走出封門村，沒想到卻被白家退婚。得知此事的幾個師姐，紛紛希望將楚凡拐到自己家中。本以為能夠享受齊人之福，然而楚凡卻發現，魔族統領，異人，天府，虛空中的玄牝之門，以及周圍飄蕩的神靈尸體，乎都在訴說著一件事——這個世界并沒有那么簡單......

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫，中醫式微。少年醫者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫發揚光大。李子明醫者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。

夢想成為建筑師的天才少年木火高考失利，被爸媽欺詐去到了自己不喜歡的土木專業。而在學校中他遇到的那些人更是奇葩異常…… 木火該如何扭轉自己的未來呢？

原本中醫系畢業的張機，因為中醫不容樂觀的就業情勢，于是打算轉行“更有前途”的西醫。然而某天他回家后，發現家中多了位不速之客——醫仙【岐伯】。岐伯以“因為你是張機（張仲景）”為理由，將“重振中醫”交給了張機。 為了讓張機可以勝任“重振中醫”的重任，岐伯遣藥靈親自教導張機中藥的配伍使用，并將一本可以與藥靈訂立契約的《玉函本草集》交由張機，同時讓人參【任弦】作為張機的幫助與監督者。