D.B星河紀元3000年左右 人類進入第二次大開發時代， 人造小行星成為主要的生活區域 在星河團中形成了龐大的交通網絡和居住星團群， 人造小行星的創制業務成為這個時代可獲得最大贏利的項目之一 ，能源的緊缺進一步出現 而土地資源隨著人造小行星的出現開始貶值 大開發時代的到來， 使得沉悶逐漸沒落的世界變得動蕩而充滿希望“ 空賊團 "”宇宙牛仔“” 空間獵人“” 雇傭軍團“” 銀河特快“ ”星球會計“ ”土地鑄造師“……各種新生行業紛紛出現。

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫，中醫式微。少年醫者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫發揚光大。李子明醫者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。

女主陽蘿目睹母親被吸入一本天書，為了尋回母親，陽蘿開始四處收集天書，并在“藏書閣”昴和男主人公習語的陪伴下，克服了種種困難。隨著收集的天書越多，陽蘿發現母親竟然是天書里面的人物，并與身為人類的父親產生了愛的結晶，生下了自己。陽蘿有一半天書血統的事瞬間引起了很多藏書閣的注意，并對陽蘿采取了回收行動。于是陽蘿一邊應對這些藏書閣，一邊加快速度收集天書。

全校只有我一個男的？”在高考失利的情況下，林昊為了放松一下心情游山玩水，卻因一場意外激發出了自己的契約師之魂，獲得了第一個幻獸。被契約師發掘后，來到了一所契約師大學開始了新的生活……

原本中醫系畢業的張機，因為中醫不容樂觀的就業情勢，于是打算轉行“更有前途”的西醫。然而某天他回家后，發現家中多了位不速之客——醫仙【岐伯】。岐伯以“因為你是張機（張仲景）”為理由，將“重振中醫”交給了張機。 為了讓張機可以勝任“重振中醫”的重任，岐伯遣藥靈親自教導張機中藥的配伍使用，并將一本可以與藥靈訂立契約的《玉函本草集》交由張機，同時讓人參【任弦】作為張機的幫助與監督者。