明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫，中醫式微。少年醫者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫發揚光大。李子明醫者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。

夜幕降臨，賣萌裝狠了一整天的動物們終于有了放松的時間，動物園的地下室（禽獸）酒館開始營業。這里有喜歡喝酒但注重養生的熊貓乖爺（中年發福），有喜歡嘻哈隨時隨地freestyle的老板兼DJ葵花鸚鵡，有（自認為）高冷的面癱藏狐小方……有趣的動物客人們紛紛登場，展現和白天的自己截然不同的一面

這家叫做“妙藥堂”的中醫診所，他的擁有者是家里世代行醫的唐本草。這個診所不光給人看病，還接待一些神秘奇異的妖怪……在大夫與病人之間，在人類與妖怪之間，發生了各種各樣的故事……

人類與靈的混血少女的血居然可以治愈妖怪難以恢復的傷，于是與各類妖怪帥哥談談戀愛冒冒險的故事就此展開~