何雨是一位普通的女生。在她居住的和善市，自古以來有著十二生肖的守護，他們擁有人類的外表和各自不同的特殊能力，每年會有一位生肖在城市中幫助并守護著人們，然而人們對此并無察覺。在何雨的本命年（猴年），她和十二生肖的猴子申君在一次偶遇中不小心將惡靈的封印解開。惡靈將其他沉睡的十二生肖一并帶走，控制了他們的心智，使他們與人類為敵。申君和何雨一起協力作戰，阻止十二生肖對城市的破壞……

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明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫，中醫式微。少年醫者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫發揚光大。李子明醫者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。