明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫，中醫式微。少年醫者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫發揚光大。李子明醫者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。

這個世界上有著許多從遠古流傳下來的“裂縫”，這些裂縫是人界與靈界之間的通道。普通的人類并不具備看到或通過裂縫的能力，但裂縫那邊的精靈可以。 于是在幾百年前，為了保持兩界平衡，人界出現了一個叫裂縫管理者的家族，他們的任務就是封印裂縫、驅逐精靈。

考古系學生依娜在望謨縣“三月三”節日中，意外被一枚琥珀吊墜帶回古夜郎世界。為返回現代，她與神鳥太芒、游俠超能栗結伴，穿越三大布依族文化秘境：以五色花米飯治愈生靈、用糠包化解姻緣之劫、借牛角抵御蟲災。途中邂逅異世少年阿布，揭開腐蝕蟲滅世危機。當月光再臨，二人重返現代，吊墜碎裂處，千年文化血脈悄然重連……

女主陽蘿目睹母親被吸入一本天書，為了尋回母親，陽蘿開始四處收集天書，并在“藏書閣”昴和男主人公習語的陪伴下，克服了種種困難。隨著收集的天書越多，陽蘿發現母親竟然是天書里面的人物，并與身為人類的父親產生了愛的結晶，生下了自己。陽蘿有一半天書血統的事瞬間引起了很多藏書閣的注意，并對陽蘿采取了回收行動。于是陽蘿一邊應對這些藏書閣，一邊加快速度收集天書。

唐小諾為了籌集給奶奶治病的錢，答應與男主角龍景琛結為合同夫妻，兩人從最開始的摩擦不斷，漸漸心意相通，最后攜手面對一切陰謀困阻……