這家叫做“妙藥堂”的中醫診所，他的擁有者是家里世代行醫的唐本草。這個診所不光給人看病，還接待一些神秘奇異的妖怪……在大夫與病人之間，在人類與妖怪之間，發生了各種各樣的故事……

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫，中醫式微。少年醫者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫發揚光大。李子明醫者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。

公爵家的千金小姐莉莉，大婚前夜卻撞破了未婚夫王子與姐姐私通，被二人喂下毒藥，丟進荒郊。命懸一線時，被戴著面具的怪物所救，怪物自稱王儲艾薩克，中了一種月圓之夜會變身嗜血怪物的詛咒，只有莉莉的血能緩解。艾薩克承諾幫莉莉復仇，作為交換，莉莉需要嫁給自己，并幫他尋找解決詛咒的方法……