白宇宙重型生命體對黑宇宙的探知中，因為無規則異界王族的介入，導致維度空間和亞空間產生無法避免的沖突，而在黑宇宙中和白宇宙重型生命體更加不兩立的戰鐵族，似乎可以平息這場紛爭，但是，萬事就怕但是……

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫，中醫式微。少年醫者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫發揚光大。李子明醫者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。