明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫，中醫式微。少年醫者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫發揚光大。李子明醫者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。

金子，省廳叱咤法醫界的法醫之花，意外穿成胤朝一縣丞家患有孤獨癥的女兒，眾人口中克死生母的不祥人。但是，她已經不是從前那個逆來順受的金子了。為了生存下去，她絕不逆來順受；而骨子里法醫的熱血，也讓她無法坐視冤案在眼前發生。就算在古代，就算身為閨閣娘子，她也要用自己的雙手，來尋找真兇。不論如何穿越，她始終還是那個為活人昭雪，為死人伸冤的女法醫！

在人類快速的發展下，人類和妖怪之間的平衡被打破。隨著環境的破壞，妖怪也不得不背井離鄉生活在人類城市。然而妖怪卻沒有屬于自己的法律保障和社會權力，這是一個人類為妖怪構建的反烏托邦！那么妖怪們究竟要如何擺脫這悲慘的命運呢？