故事講述了個性開朗喜歡搗亂的小學生布丁，和性格有點暴躁的黃連，倆人的日常校園生活故事。

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明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫，中醫式微。少年醫者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫發揚光大。李子明醫者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。

一個是叱咤仙路的風云上神，一個是廢材資質修真菜鳥，當網游遭遇修真，還有什么是不可能的呢？ 昔日等級榜第一大神跌落云端，廢柴醫師掉進修真世界。小小菜鳥又該如何一步一個腳印，攀上這云海盡頭，蒼嵐之巔？萌獸or美男？仙術or神通？丹藥or法寶？修真菜鳥的逆襲日記從現在開始書寫！即使大道無情，艱險叢生，萌妹子也要闖出一片天！