明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫，中醫式微。少年醫者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫發揚光大。李子明醫者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。

云清觀有一名能讓其師父聞風喪膽的呆萌道士，天天以學術詢人，各種問題層出不窮，簡直是十萬個為什么...這人就是楊修慕。他每天老老實實踏踏實實的修行捉妖，卻在某一天，成了這只小老鼠精的俘虜！老鼠陰險狡詐，他當然不是對手，輕松的就交上了自己的心...

一次偶然的意外，讓他們心懷誤會，十年后再次相遇，她卻沒有認出他，漸漸浮出水面的真相，我們.....能否再續前緣？