二十四節氣不僅僅代表著日月運行位置和天氣、動植物生長等自然現象，它還代表著華國數千年的文化精髓，以及華國人骨子里的底蘊。小神醫四季一個聰明伶俐的小蘿莉，和活波可愛的熊貓咪嘟嘟，當兩個小可愛遇見傳統的二十四節氣，會不會帶給我們一個不一樣的華國傳統文化呢？

2333年，地球被寒，藻，葳，雛，炎，氣，六星攻占，長得好看的人成為寵物，長得丑的被丟到荒野沙漠自生自滅。六星人養膩了現代人想養古人，于是發明了名將機，啟動后能穿越時空抓古人。誰知，天真的葳星少女伊塔一發入魂，抓到了秦始皇嬴政，給六星帶來了毀滅性打擊。寄（外星）人籬下的秦始皇與同人文寫手徐君房和總想暗殺自己的張良以及其他被抓來的千古名將們放下前朝舊恨共同抵御天外之敵！

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫，中醫式微。少年醫者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫發揚光大。李子明醫者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。