隨著21世紀末的鐘聲響起，宣告著核武的沒落。地球因核戰四分五裂。執念者們陰差陽錯獲得了異能，為了克制暴亂的異能者，城市的人們成立專門組織——異能回收小組。主要負責強行拘捕不愿被政府管轄的異能者。一場屬于異能者們的戰斗全面展開……

不婚主義者一旦懷孕，那該怎么辦？閔恩樹是一個不婚主義者，她是最年輕的團隊主管，現在秘密戀愛已經三年，男朋友是另一部門負責人徐之訓。徐之訓自認為二人已到談婚論嫁的程度，因此向恩樹求了婚。意料之外，求婚被恩樹拒絕。沉浸在痛苦中的閔恩樹在歡迎會上醉得一塌糊涂，借著酒勁，沖動之下與送她回家的下屬職員在過了一晚。恩樹恢復清醒后，身體卻未如她所愿，產生了一些異常，本以為只是單純的胃腸不適，卻被醫生告知是懷孕。

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫，中醫式微。少年醫者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫發揚光大。李子明醫者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。